Die Universität Osnabrück ist vielfach Kooperationspartner der Stadt Osnabrück in friedenskulturell relevanten Themenstellungen. Gemeinsam sind beide Träger des Erich Maria Remarque-Friedenszentrums und Veranstalter der Osnabrücker Friedensgespräche.
Das Büro für Friedenskultur im Fachbereich Kultur und auch andere Bereiche der Stadtverwaltung kooperieren inhaltlich regelmäßig mit dem universitären Institut für Migrationsforschung und Interkulturelle Studien (IMIS) im Themenbereich Migration und Integration. Zudem gibt es zahlreiche projektbezogene Kooperationen mit Fachbereichen der Universität, unter anderem Kultur- und Geowissenschaften, Sprach- und Literaturwissenschaften, Erziehungswissenschaften, Sozialwissenschaften und mit der Arbeitsgruppe Dritte Welt – Umwelt und Entwicklung.